新风机组的控制包括送风温度控制、送风相对湿度控制、防冻控制、CO2浓度控制和各种联锁内容。如果新风机组应承担室内负荷(如直流机组)，则应控制室内温度(或室内相对湿度)。
　　1.送风温度控制。
　　送风温度控制是指定的出风口温度控制，其适用条件通常是新风机组用于满足室内卫生要求而不是承担室内负荷。因此，在整个控制时间内，供气温度应保持恒定。由于冬季和夏季的室内要求不同，冬季和夏季的送风温度应该有不同的要求。也就是说，新风机组恒定送风温度的控制有两个控制值——冬季控制值和夏季控制值，因此需要考虑控制器冬夏季工况之间的转换。
　　在控制送风温度时，通常是夏季控制冷盘管的水量，冬季控制热盘管的水量或蒸汽盘管的蒸汽流量。两联供和中央空调为了便于管理，温度传感器一般安装在机组所在机房的送风管道上。
　　2.室内温度控制。
　　对于一些直流系统，新鲜空气不仅可以使环境达到卫生标准，还可以承受所有室内负荷。由于室内负荷在变化，低温空气源热泵两联供控制送风温度的方式不能满足室内要求(可能是过热或过冷)。因此，必须控制使用场所的温度。因此，温度传感器必须安装在控制室的典型区域。由于直流系统通常配备有排气系统，因此将温度传感器安装在排气管中并考虑一些修改也是一种可行的方法。
　　除直流系统外，新风机组通常与风机盘管一起使用。在一些项目中，由于各种原因(如风机盘管机组的除湿能力限制等。)，新风机组在设计中承担部分室内负荷，对于新风机组来说，在设计状态下根据送风温度进行控制不是问题。但当室外气候发生变化，达到室内热平衡时(如过渡季节的某段时间)，如果持续控制送风温度，必然会造成房间过冷(在有冷水供应的情况下)或过热(在有热水供应的情况下)，因此应采用室内温度控制。因此，在这种情况下，水机两联供地冷全年运行应采用送风温度和室内温度相结合的控制模式。